Mitropolia Basarabiei este parte componentă a Patriarhiei Române și a fost reactivată la 14 septembrie 1992, dar a fost înregistrată de către autorităţile de la Chişinău abia în 2003.
Ea a devenit subiect de dispute între Biserica Ortodoxă Română și cea Rusă încă din momentul reactivării sale.
Biserica Rusă a fost susţinută în demersurile sale şi de către oficialităţile de la Chişinău care au considerat decizia de reactivare a Mitropoliei Basarabiei ca pe un amestec în treburile interne ale Republicii Moldova.
Autoritățile din Republica Moldova au fost totuşi nevoite să o înregistreze în urma unei decizii a Curţii Europene a Drepturilor Omului din 2001.
Mitropolia Basarabiei a fiinţat pe teritoriul actualei Republici Moldova până în 1944, când a fost lichidată odată cu instaurarea aici a regimului sovietic.
În prezent, Mitropolia Basarabiei are înregistrate oficial peste 300 aşa-zise părţi componente care includ parohiile, mănăstirile, misiunile etc, iar Mitropolia Moldovei, subordonată canonic Patriarhiei Ruse, – aproximativ 1300 de părţi componente.
Mitropolia Basarabiei are statut autonom în cadrul Patriarhiei Române și este de stil vechi.
